除了林宅血案之外，台灣歷史上仍有數起重大懸案至今未解，持續引發社會關注。這些案件如同歷史的傷痕，不僅對受害者家屬造成難以彌補的痛苦，也反映出台灣社會在轉型過程中，正義伸張與真相追尋的困境。以下列舉數起備受矚目的懸案：
1984年，華裔美籍作家劉宜良（筆名江南）在美國遭到槍殺。此案經美國聯邦調查局（FBI）介入調查後，發現與台灣情報部門有關。儘管涉案兇手已逮捕，但幕後主使者與真相至今仍存在爭議，成為國際矚目的政治事件。
1981年，數學家陳文成在返台探親期間，遭到警備總部約談後離奇身亡。由於陳文成生前曾參與海外台灣獨立運動，其死因引發各界揣測，質疑警備總部涉及不當偵訊甚至謀殺。儘管政府事後進行調查，但真相仍未完全釐清，成為台灣人權史上的一大污點。
1993年，海軍上校尹清楓在調查軍購弊案期間離奇身亡。由於尹清楓掌握了大量軍購黑幕，他的死被認為與軍方高層貪腐有關。儘管檢方曾大舉偵辦，但始終未能找到直接證據，使得此案成為一樁懸案，也暴露了台灣軍購體系的弊端。
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